跨境电商全流程需要采购供应、物流配送、电子支付、售后服务等环节的衔接配合，任何环节出问题都可能影响跨境电商的发展。

　　一是供货渠道受限，难以保证货源数量及品质。目前进口跨境电商货源采购多由个人买手或者是专业团队向国外零售商代购，再销售给国内消费者。除了天猫国际、苏宁易购等大型电商与海外直接洽谈对接外，其他的跨境电商与海外品牌商家未能实现货源上对接，很难取得国外品牌商或大型零售商的授权。跨境电商进货渠道窄且不固定，对海外货源掌控力弱，货源品质得不到保证，造成供货不及时，甚至成为假货销售的平台。

　　二是物流瓶颈成为跨境电商切肤之痛。主要表现在两个方面：一方面，国内物流企业与国际物流公司差距较大，难以有效满足电商和消费者的需求。国内物流企业在全球的覆盖范围、物流仓储设施、物流配送效率、物流信息处理、物流服务系统等方面尚处于低水平。依靠转运公司完成跨境物流容易造成供应链断裂，降低商品流转速度。另一方面，海外建仓使电商告别传统快递模式，远程掌控物流供应链，但同时也面临巨大挑战。海外仓库更多地聚焦于提高库存周转、降低运营成本等问题，服务系统不完善，货物转仓信息登记不及时、货物丢失、客户信息泄露、仓库与客服信息衔接不畅等问题时有发生。

　　三是电子支付面临制度困境和技术风险。跨境电商支付涉及到国际贸易、外汇管理等环节，复杂程度较高。跨境电商第三方支付行业发展迅速，支付宝、易宝支付、钱宝、京东网银等22家第三方支付公司已经获得跨境电商外汇支付业务试点资格，拥有跨境支付牌照，被允许通过银行为小额电子商务交易双方提供跨境互联网支付所涉及的外汇资金集中收付和相关结汇服务。但是第三方支付还是面临不少现实困难。通关、退税等跨境业务复杂，在一定程度上制约跨境支付的推进。境外买家支付美元不能直接到国内兑换成人民币，企业资金回笼面临外汇兑换问题。目前缺乏统一的法律法规制度对跨境支付加以规范，支付信用安全风险、跨境消费者和商户身份认证技术性风险高，跨境交易资金流向监管难。

　　四是售后服务难题让消费者望而却步。对于国内消费者而言，海外购商品的售后服务面临一系列的麻烦。由于涉及到跨境通关和物流，换货后的商品很难有顺畅的通道返回国内;物流等种种费用要消费者承担，出现退货费用严重超出货品价值的现象;同时，跨境购的商品质量维权、货品丢失处理、技术售后服务等都需要耗费巨大时间成本，让消费者打消跨境购的念头。